在“东京决战”硝烟散去一年之后,布里塔尼亚少年鲁路修在曾经的日本国,如今的11区,看似过着普通学生的平静生活。然而,一次与弟弟罗洛的外出,却意外让他与黑色骑士团的残余势力重逢。在与神秘少女C.C再度缔结契约后,鲁路修尘封已久的记忆如潮水般涌来。
身为布里塔尼亚帝国的王子,鲁路修怀揣着建立一个没有阶级、人人平等,且能让妹妹娜娜丽幸福生活的世界的宏愿。为此,他借助GEASS那令人无法抗拒的绝对服从之力,引领黑色骑士团向强大的帝国发起了挑战。他化身为戴着假面的ZERO,却在一年前的“东京决战”中,被挚友朱雀击败,记忆也被帝国皇帝无情抹去。
如今,记忆复苏的鲁路修,不仅要直面帝国那坚不可摧的军事力量,还要应对身边复杂多变的人际关系:虚情假意的弟弟罗洛、下落不明的妹妹娜娜丽、立场不明的中华联盟,以及内部产生裂痕的黑色骑士团。在重重困境与危机之中,鲁路修毅然踏上了被GEASS之力诅咒的孤独王者之路。