机动战士Z高达的故事背景设定在机动战士高达系列中一年战争结束后的第七年。当时,尽管战争已宣告终结,但仍有部分吉恩公国的军事势力拒不投降,继续在各地与地球联邦军发生军事冲突。面对这一局势,地球联邦军内部出现了一股主张彻底清除吉恩残余势力的激进排他势力——泰坦斯(Titans)。泰坦斯在执行任务时手段强硬且血腥,对宇宙住民进行了残酷镇压,这一行为激起了广泛的反抗情绪,最终促使反势力奥干A.E.U.G.(在台湾被称为奥干,在香港则译为奥古)应运而生。
故事始于宇宙世纪0087年(U.C. 0087),剧情前半部分主要聚焦于奥干与泰坦斯两大派系之间的激烈对抗。随着情节的深入,吉恩的残余势力——上阿克西斯(在香港被称为阿古捷斯)也加入了这场混战,与奥干和泰坦斯展开了一场错综复杂的角力与激战。